Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna1P52793 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna1P52793 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna1P52793 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms