Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Polr1cP52432 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr1cP52432 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms