Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr4P51680 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms