Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa6P50704 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa6P50704 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa6P50704 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa6P50704 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms