Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csrp3P50462 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csrp3P50462 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms