Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psen1P49769 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psen1P49769 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms