Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtpreP49446 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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