Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CitP49025 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CitP49025 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CitP49025 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CitP49025 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CitP49025 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CitP49025 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CitP49025 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CitP49025 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CitP49025 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CitP49025 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CitP49025 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CitP49025 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CitP49025 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CitP49025 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CitP49025 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CitP49025 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CitP49025 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms