Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnni3P48787 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnni3P48787 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms