Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prox1P48437 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms