Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Abcd1P48410 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcd1P48410 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms