Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VdrP48281 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VdrP48281 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VdrP48281 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VdrP48281 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VdrP48281 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VdrP48281 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
VdrP48281 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VdrP48281 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VdrP48281 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VdrP48281 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VdrP48281 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VdrP48281 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms