Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdkn1bP46414 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdkn1bP46414 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms