Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ItgavP43406 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms