Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NodalP43021 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NodalP43021 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NodalP43021 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NodalP43021 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NodalP43021 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NodalP43021 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NodalP43021 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms