Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx2-2P42586 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx2-2P42586 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms