Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TfamP40630 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TfamP40630 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TfamP40630 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TfamP40630 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TfamP40630 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TfamP40630 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TfamP40630 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms