Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ThpoP40226 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ThpoP40226 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms