Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chd1P40201 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd1P40201 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd1P40201 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd1P40201 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms