Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col18a1P39061 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col18a1P39061 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col18a1P39061 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms