Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddit3P35639 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddit3P35639 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddit3P35639 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddit3P35639 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddit3P35639 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddit3P35639 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddit3P35639 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms