Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpardP35396 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpardP35396 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpardP35396 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpardP35396 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpardP35396 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms