Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab20P35295 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms