Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab23P35288 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms