Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc5P32043 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms