Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcdP28867 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms