Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GrnP28798 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GrnP28798 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GrnP28798 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GrnP28798 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GrnP28798 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GrnP28798 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms