Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms