Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apex1P28352 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms