Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Etv4P28322 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms