Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gjb3P28231 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms