Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CebpbP28033 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CebpbP28033 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms