Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2afxP27661 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms