Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl3P27659 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms