Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms