Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
U2af2P26369 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
U2af2P26369 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
U2af2P26369 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms