Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CftrP26361 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CftrP26361 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CftrP26361 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CftrP26361 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CftrP26361 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CftrP26361 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CftrP26361 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CftrP26361 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CftrP26361 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CftrP26361 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CftrP26361 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CftrP26361 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CftrP26361 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CftrP26361 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CftrP26361 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CftrP26361 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CftrP26361 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CftrP26361 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CftrP26361 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CftrP26361 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CftrP26361 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CftrP26361 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CftrP26361 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CftrP26361 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CftrP26361 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CftrP26361 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CftrP26361 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CftrP26361 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CftrP26361 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms