Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabra3P26049 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra3P26049 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms