Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmo2P25801 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo2P25801 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms