Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk11bP24788 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cdk11bP24788 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk11bP24788 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms