Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Myf5P24699 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myf5P24699 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms