Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd247P24161 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd247P24161 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd247P24161 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms