Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gria1P23818 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gria1P23818 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms