Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tsta3P23591 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms