Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkchP23298 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkchP23298 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms