Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RarbP22605 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RarbP22605 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RarbP22605 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RarbP22605 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RarbP22605 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RarbP22605 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RarbP22605 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RarbP22605 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RarbP22605 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RarbP22605 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RarbP22605 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms