Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnnc2P20801 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms