Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb9P20615 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb9P20615 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms