Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou5f1P20263 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou5f1P20263 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms