Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ifrd1P19182 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms